Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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