Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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CUL3Q13618 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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CUL3Q13618 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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CUL3Q13618 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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CUL3Q13618 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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CUL3Q13618 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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CUL3Q13618 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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CUL3Q13618 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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CUL3Q13618 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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