Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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