Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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