Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.3 ms