Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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SGCGQ13326 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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SGCGQ13326 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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SGCGQ13326 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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SGCGQ13326 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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SGCGQ13326 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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