Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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