Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms