Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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