Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD3Q12873 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD3Q12873 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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