Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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