Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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KCNMA1Q12791 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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KCNMA1Q12791 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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KCNMA1Q12791 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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KCNMA1Q12791 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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