Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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