Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L18D6R9N7 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms