Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms