Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms