Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
C4orf17Q53FE4 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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