Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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