Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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