Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms