Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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