Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEDD8Q15843 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms