Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms