Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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