Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms