Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE4AQ14139 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms