Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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