Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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