Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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FOXE3Q13461 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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FOXE3Q13461 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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FOXE3Q13461 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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FOXE3Q13461 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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FOXE3Q13461 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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