Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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