Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ITGB3BPQ13352 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms