Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms