Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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