Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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