Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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