Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
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