Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms