Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms