Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
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