Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms