Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPREP23469 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPREP23469 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPREP23469 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPREP23469 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPREP23469 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPREP23469 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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