Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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CLDN9O95484 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CLDN9O95484 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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CLDN9O95484 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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CLDN9O95484 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CLDN9O95484 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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CLDN9O95484 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CLDN9O95484 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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CLDN9O95484 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CLDN9O95484 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN9O95484 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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