Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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