Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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USP35Q9P2H5 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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USP35Q9P2H5 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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USP35Q9P2H5 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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USP35Q9P2H5 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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USP35Q9P2H5 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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USP35Q9P2H5 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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USP35Q9P2H5 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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USP35Q9P2H5 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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