Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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HOXD1Q9GZZ0 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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HOXD1Q9GZZ0 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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HOXD1Q9GZZ0 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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HOXD1Q9GZZ0 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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HOXD1Q9GZZ0 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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HOXD1Q9GZZ0 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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HOXD1Q9GZZ0 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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HOXD1Q9GZZ0 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD1Q9GZZ0 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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