Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CTXN3Q4LDR2 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms