Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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