Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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RTN1Q16799 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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RTN1Q16799 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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RTN1Q16799 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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RTN1Q16799 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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RTN1Q16799 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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RTN1Q16799 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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RTN1Q16799 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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