Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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