Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms